Главная \ Гинекологам \ Кишечная микрофлора и ее связь с преждевременными родами

Кишечная микрофлора и ее связь с преждевременными родами

Кишечная микрофлора и ее связь с преждевременными родами

Преждевременные роды: причины и факторы риска

Исследования микрофлоры у женщин разного гестационного срока

Анализ полиморфизма длины рестрикционных фрагментов (T-RFLP)

Дисбактериоз как одна из причин преждевременных родов

Таблица 1. Клинические характеристики участвовавших.

Таблица 2. Таксономические оперативные единицы в фекальных образцах

Таблица 3. Таксономические оперативные единицы в вагинальных образцах

 

Исследования показывают, что преждевременные роды могут быть вызваны диcбактериозом.  Нарушения в оральной или кишечной микрофлоре могут подвергнуть инфекции матку или плаценту. Поэтому во время беременности необходимо следить за состоянием кишечной и вагинальной микрофлоры, а также микрофлоры полости рта.

Опубликовано 5 ноября 2014. Авторы исследования: Arihiro Shiozaki, Satoshi Yoneda, Noriko Yoneda, Rika Yonezawa, Takamichi Matsubayashi, Genichiro Seo, Shigeru Saito

Преждевременные роды – ведущая причина перинатальных болезней и смертности. Исследования, использовавшие метод культивации или молекулярную идентификацию, показали, что бактериальный вагиноз – это один из факторов риска преждевременных родов. Однако нигде не сообщается об использовании молекулярной техники при связи между преждевременными родами и кишечной микрофлорой, хотя вагинальная микрофлора меняется во время беременности. Нашей целью было прояснить разницу состояний кишечной и вагинальной микрофлоры у женщин с преждевременными родами и женщинами, родившими в срок. Гены 16S-рибосомной рибонуклеиновой кислоты, взятые из фекальной и вагинальной ДНК, были увеличены при помощи полимеразной цепной реакции.Используя конечный ограничительный фрагмент полиморфизма (T-RFLP), мы сравнили уровни оперативных таксономических единиц кишечной и вагинальной флоры среди трёх групп: беременные женщины, родившие доношенных младенцев в срок (кол-во: 20); беременные женщины, родившие доношенных младенцев раньше срока (кол-во: 11); беременные женщины, родившие раньше срока (кол-во: 10). Значительно низкие уровни  ClostridiumsubclusterXVIII, ClostridiumclusterIV, ClostridiumsubclusterXIVи Bacteroides, а также значительно высокий уровень Lactobacillales наблюдались в кишечной микрофлоре группы с преждевременными родами и недоношенными детьми по сравнению с группой с преждевременными родами и доношенными детьми. Уровни Clostridiumsubcluster XVIII и ClostridiumsubclusterXIVa в группе с преждевременными родами и недоношенными детьми были значительно ниже, чем в группе с преждевременными родами и недоношенными детьми. Однако значительных различий в вагинальной микрофлоре трёх групп не было замечено. При использовании метода T-RFLP было замечено, что кишечная микрофлора группы с преждевременными родами и недоношенными детьми отличается от микрофлоры группы, родившей в срок.

Преждевременные роды: причины и факторы риска

Внутри и на поверхности нашего тела содержится более 100 трлн микробов. Эти микробы составляют нашу микробиоту. (1, 2) Лишь небольшая часть этой микробиоты может быть культивирована в среднем, но независимые от культуры анализы – например, геномный анализ 16Sрибосомной рибонуклеиновой кислоты (3, 4) и метагеномный анализ (5) революционизировали наше понимание микрофлоры.Микрофлора нашего кишечника играет огромную роль в здоровье и болезнях (1) организма. Кишечная микрофлора взаимодействует с иммунной системой и подаёт сигналы для ускорения созревания иммунных клеток и нормального развития иммунных функций (6,7,8).

Преждевременные роды (ПВР) – главная причина перинатальной заболеваемости и смертности в развивающихся и развитых странах (9). Частота ПВР составляет 12-13% в США и от 5 до 9% в других развитых странах, включая Японию. Спонтанные ПВР рассматривают как синдром, к которому привели многочисленные причины, включая внутриматочные инфекции или воспаления, стресс, социально-экономическая среда и маточноеперерастяжение. Факторы риска ПВР в западных странах включают в себя:

  • предыдущие преждевременные роды;
  • темнокожих людей;
  • периодонтальные (околозубные) заболевания;
  • низкий ИМТ;
  • короткую шейку матки;
  • повышенную шейно-вагинальную внутриутробную концентрацию фибронектина.

В Японии факторами риска являются:

  • частая беременность;
  • короткая шейка матки;
  • использование стероидов при астме или коллагеновой болезни;
  • низкий уровень образования
  • плод мужского пола (10).


Несмотря на то что лечение антибиотиками может уничтожить бактериальный вагиноз при беременности, общий риск ПВР среди беременных с бактериальным вагинозом незначительно снижается при лечении антибиотиками (11).

Нигде не приводится данных об использовании молекулярной техники для обнаружения связи между преждевременными родами и кишечной микрофлорой, хотя вагинальная микрофлора  при беременности меняется. Аагаард и др. (12) показали, что характеристики вагинальной микрофлоры при беременности отличались от характеристик микрофлоры небеременных женщин с изменениями таксонов через вагинальные субсайты и в зависимости от возраста беременной. Ромеро и др. сообщили, что в длительном исследовании  Lactobacillusspp были преобладающими членами микробного сообщества при нормальной беременности (13), и они не отмечали различий в вагинальной микрофлоре  между  женщинами, родившими раньше срока, и родившими в срок (14).Корен и др. описали серьёзные изменения кишечной микрофлоры в течение беременности (15). Эти изменения кишечной микрофлоры вызвали резистентность к инсулину во время беременности. Хотя при помощи геномного анализа, основанного на 16S рДНК, были изучены такие аномалии вагинальной микрофлоры, как бактериальный вагиноз (16), у нас нет отчётов о связи между ПВР и кишечной микробиотой, как определил геномный анализ.

В анализе T-RFLP использованы нецелевые подходы для идентификации различий и сходств микробных сообществ, но он не предоставляет прямой последовательной информации. Из-за своей относительной простоты анализ T-RFLP применялся для анализа бактериальных генов 16SрРНК и предоставлял лёгкие средства для оценки изменений в микробных сообществах (17).

 

В данном перекрёстном исследовании, в котором используется анализ T-RFLP, мы изучили производные от бактерий гены 16S рРНК в фекалиях и вагинальные выделения, чтобы определить, различается ли микрофлора в трёх группах: женщины, родившие в срок; женщины, родившие доношенных детей, но раньше срока; женщины, родившие недоношенных детей раньше срока.

Исследования микрофлоры у женщин разного гестационного срока

Данное исследование является проспективным и перекрёстным. Протокол исследования и документы на разрешение были изучены и одобрены в Университете Тоямы. Письменные документы на разрешение были получены от всех субъектов, участвовавших в исследовании. С 2011 по 2013 год участники были разделены на три группы:

  1. Женщины, родившие в срок (кол-во: 20)
  2. Женщины с сокращениями матки, получавшие токолитические (снижающие родовую деятельность) агенты, но родившие доношенных детей (кол-во: 11)
  3. Женщины с сокращениями матки, получавшие токолитические (снижающие родовую деятельность) агенты и родившие недоношенных детей (кол-во: 10).

Женщины, находившиеся на сроке беременности меньше 22 недель, и те, кто принимал антибиотические, токолитические и стероидные вещества, были исключены из испытания. Вагинальные образцы были получены из заднего влагалищного свода при помощи мазка. Тампон был погружен в вагинальные выделения на 10 секунд, затем быстро помещён в 3 мл буферного раствора (100 мМTris-HCl, pH 9.0, 40 mMTris-EDTA, pH 8.0 и 4 M гуанидинатиоцианата). Затем он хранился при температуре -20С. Фекальные образцы были собраны дома или в нашей больнице. Унитаз накрыли стерильным листком бумаги, временно водонепроницаемым. Тем не менее, листок мог раствориться в воде унитаза за несколько минут, а остатки стула могли его смыть. Очищенные фекальные образцы были быстро собраны при помощи стерильной ложки  или тампона, помещены в 3 мл буферного раствора, а затем хранились при температуре -20С.

 

Анализ полиморфизма длины рестрикционных фрагментов (T-RFLP)

Для исследования микрофлоры фекальных и вагинальных образцов, полученных от всех субъектов, был проведён анализ полиморфизма длины рестрикционных фрагментов (T-RFLP), как было сообщено раньше (18).

Фекальные и вагинальные образцы были помещены в раствор, содержащий 100 mMTris-HCl, pH 9.0, 40 mMTris-EDTA, pH 8.0 и 4 М гуанидинатиоцианата и хранились при температуре -20С до выделения ДНК. Аликвота 0.8 мл взвеси была гомогенизирована при помощи двуокиси циркония в трубке 2.0 мл с использованием FastPrep FP120A Instrument (MP Biomedicals, Irvine, CA) и помещена на лёд. После центифугирования (5000 на г, в течение 1 минуты) супернатант был помещён в автоматическую систему выделения нуклеиновой кислоты 12GCPrecisionSystemScience, Chiba, Japan). После этого ДНК была получена из гомогенизированной взвеси с использованием Magtration-MagaZorb DNA CommonKit 200 N (PrecisionSystemScience, Chiba, Japan).

16Sр ДНК была расширена из ДНК человеческих фекалий при помощи использования флуоресцентного праймера  516f  (59-(6-FAM)-TGCCAGCAGCCGCGGTA-39) и праймера 1492r (59-GGTTACCTTGTTACGACTT-39); из ДНК вагины – при помощи флуоресцентных праймеров 27f (59-(6-FAM)-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-39) и 1492r (59-GGTTACCTTGTTACGACTT-39), с полимеразой ДНК Hot-starTaq, используя систему ПЦР GeneAmp 9600 (AppliedBiosystems, CA, USA). Программа амплификации была следующей: предварительный разогрев при 95С в течение 15 минут; 30 циклов денатурации при 95С в течение 30 секунд, ренатурация (отжиг) при 50С в течение 30 секунд, вытягивание при 72С в течение 10 минут. Амплифицированная ДНК была очищена при помощи MultiScreenR PCRm96 FilterPlate (Millipore, MA, USA) и проверена при помощи электрофореза.

Рестрикционные ферменты были отобраны согласно Нагашиме и др. (19) В целом, продукт ПЦР, очищенный от фекальных образцов, был усвоен при помощи 10 U Bsl I (NewEnglandBioLabs, Inc., Ipswich, USA) при температуре 37С в течение 3 часов; продукт ПЦР, очищенный от вагинальных образцов, был усвоен при помощи 10 U Msp I (TAKARA, Shiga, Japan) при температуре 37С в течение 3 часов. Фрагменты ДНК, полученные в результате, в частности, флуоресцентные рестрикционные фрагменты (T-RFs), были проанализированы при помощи генетического анализатора ABI PRISM 3130xl. Их длина и площадь пика были определены при помощи программного обеспечения генотипа GeneMapper (AppliedBiosystems).

Согласно методам, описанным Нагашимой и др. (19), рестрикционные фрагменты были разделены на 29 таксономических оперативных единиц (фекальные образцы) или на 22 таксономические оперативные единицы (вагинальные образцы). Эти единицы измерили в процентном значении. Для минимизации коэффициентов вариаций единиц один из авторов провёл все анализы.

Для объективной интерпретации различий образцов анализа T-RF были проведены кластерные анализы (IBM Statistics, ver. 20.0, NY, USA). Образцы, произведённые из энзимов (Bsl I orMsp I) были подсчитаны в пропорциях площади пика всех образцов. Уровни схожести среди фекальных и вагинальных образцов были подсчитаны как коэффициенты корреляции и наглядно представлены в графике рассеивания, используя анализ главных компонентов.

 

Статистический анализ

Все значения таксономических оперативных единиц выражены средним арифметическим плюс минус стандартная ошибка. Сравнения количественных данных среди трёх групп были проведены при помощи техники многоразового сравнения. Неправильные показатели открытий были подсчитаны при помощи метода Бенджамини-Хохберга. Разница была значительной при значении Р меньше 0.05. Для многомерного анализа данных были использованы анализ основных компонентов и кластерный анализ. Анализ основных компонентов был неконтролируемым.

Результаты

Из 21 женщины с преждевременными родами 10 женщин (47,6%) родили детей раньше 37 недели беременности.

Анализ главных компонентов

Фекальные образцы. Анализ был проведён на основе относительного избытка таксономических оперативных единиц в фекальных образцах. Были подсчитаны показания первых двух главных компонентов, которые отвечали за 19.7% и 10.4%  общих вариаций. Иерархическое объединение фекальных образцов на основе показателей первых двух главных компонентов разделило фекальные образцы на два первичных скопления (Рисунок 1А). Одно скопление («скопление 1», обозначено пунктиром, слева на рисунке 1А) включало в себя все 10 случаев группы с преждевременными родами, а также 2 из 20 случаев группы, родившей в срок, и 7 из 11 случаев группы, родившей доношенных детей раньше срока. Другое скопление («скопление 2», обозначено жирной линией, справа на рисунке 1А) представляет собой 90% группы, родившей в срок (18 из 20) и 36.4% (4 из 11) случаев группы, родившей доношенных детей раньше срока. Скопление 2 не включало в себя случаи группы с преждевременными родами. Группа, родившая доношенных детей раньше срока, располагается между группами, родившей в срок и с преждевременными родами.

Вагинальные образцы. В вагинальных образцах были подсчитаны показания двух главных компонентов, которые отвечали за 18.5% и 15.8% общих вариаций соответственно (Рисунок 1В). Анализ показал, что у трёх групп есть общие черты.

Данные полиморфизма длины рестрикционных фрагментов

Процент таксономических оперативных единиц (процентное значение одной таксономической оперативной единицы на общее значение) в образцах фекалий после усвоения Bsl I показаны в Таблице 2, а в вагинальных образцах после усвоения Msp I – в Таблице 3.

Фекальные образцы. При сравнении соответствующих таксономических оперативных единиц между группой, родившей доношенных детей раньше срока, и группой, родившей недоношенных детей раньше срока, площади пика таксономических оперативных единиц 650, 657, 749, 853 и 955 (после усвоения Bsl I) значительно различались (Таблица 2). (???) Количество ClostridiumclusterXVIII (650), ClostridiumclusterIV (749), Bacteroides  (853) и ClostridiumsubclusterXIVa (955) было значительно ниже в группе с преждевременными родами и недоношенными детьми, чем в группе с преждевременными родами и доношенными детьми (P= 0.0125, P= 0.0289, P= 0.0348, and P= 0.0005 соответственно). Количество Clostridiumcluster XVIII и ClostridiumsubclusterXIVa в группе, родившей в срок, было выше, чем в группе, родившей доношенных детей раньше срока(P =0.0449 и P= 0.0125 соответственно).

При сравнении соответствующих таксономических оперативных единиц между группой, родившей в срок, и группой с преждевременными родами, количество Clostridiumcluster XI и ClostridiumsubclusterXIVa (919) было значительно ниже в группе с преждевременными родами (P= 0.0285).

Вагинальные образцы. Напротив, процент таксономических оперативных единиц после усвоения Msp I в группе, родившей в срок доношенных детей, был схож с показателями в двух других группах (Таблица 3).

Разница в результатах исследований кишечной микрофлоры у групп, родивших доношенных и недоношенных детей

В этом исследовании мы показали, что фекальная микрофлора в группе, родившей доношенных детей в срок, отличается от микрофлоры группы, родившей доношенных детей раньше срока. Общие показатели таксономических оперативных единиц 650, 749, 853 и 955 были значительно ниже в фекальной микрофлоре группы с преждевременными родами и недоношенными детьми, чем в микрофлоре группы с преждевременными родами и доношенными детьми. Нагашима и др. (19) сообщили, что таксономические оперативные единицы 749 и 955 представляют скопления Clostridiumcluster IV и ClostridiumsubclusterXIVaсоответственно.Суммируя всё вместе, мы выяснили, что уровни  ClostridiumclusterXVIII, ClostridiumclusterIV, ClostridiumsubclusterXIVa и Bacteroides были понижены в фекальной микрофлоре группы с преждевременными родами и недоношенными детьми.Наши результаты показали разницу показателей таксономических оперативных единиц ClostridiumclusterXVIII, ClostridiumclusterIV и ClostridiumsubclusterXIVa между мамами, родившими доношенных детей в срок и родившими раньше срока недоношенных детей, в то время как мамы, родившие доношенных детей раньше срока, имели показатели между этими группами.

Это открытие не означает, что кишечная микробиота случайно изменилась в группе с преждевременными родами и недоношенными детьми, а предполагает, что некоторые изменения в кишечной микробиоте связаны с клиническими результатами матерей с недоношенными детьми.

Наши результаты совпадают с отчётом Ромеро, который не обнаружил различий в вагинальной микрофлоре женщин со спонтанными преждевременными родами и родами в срок. Кроме того, более поздние исследования показали, что бактерии из ротовой полости чаще всего есть в околоплодных водах пациенток с преждевременными родами, и демонстрируют, что периодонтальные патогены могут достигнуть плаценты и распространиться в кровообращении плода и околоплодной жидкости (20). Взятые вместе, эти открытия могут предположить, что оральная и/или кишечная, но не вагинальная микрофлора может вызвать патогены и воспалительных переносчиков на повышенных уровнях, что в свою очередь может вызвать преждевременные роды и предположить, что дисбактериоз, вызванный оральной и/или кишечной микрофлорой, может подвергнуть инфекции матку или плаценту.

Была установлена связь бактерий, относящихся к бактериальному вагинозу, в порядке Clostridiales: BVAB1, BVAB2, BVAB3 (21). Фоксман и др. сообщили о том, что в выделениях влагалища бактерия BVAB3 была связана с понижением риска преждевременных родов для всех этнических групп (коэффициент риска: 0.55; 95% доверительный интервал: 0.39–0.78) [22]. Результат схож с нашими открытиями: уровень клостридий был значительно ниже при преждевременных родах, хотя их уровень в наших исследованиях был ниже в образцах фекальных, а не вагинальных.

Пишут, что во врождённой микрофлоре толстой кишки мыши и человека ген Clostridium, принадлежащий скоплению XIVa и IV, является важным возбудителем CD4+  CD25+ Foxp3+ регуляторных Т-клеток (7,8). Bacteroidesfragilis также вызывает регуляторные Т-клетки у мышей  (23). Было высказано предположение, что полисахарид А, который выделяют Bacteroidesfragilis, усиливает супрессорную деятельность регуляторных Т-клеток. Баланс между полезными и потенциально вредными видами в комменсальных микробных сообществах, известный как дисбактериоз, зачастую связывают с развитием воспалительной болезни кишечника у людей и аналогичного кишечного воспаления у мышей (18). Важно, что кишечные регуляторные Т-клетки играют ключевую роль в регулировочном воспалении, выделяя IL-10 (8, 23, 24, 25). У пациентов с воспалительной болезнью наблюдалось пониженное количество регуляторных Т-клеток. Преждевременные роды могут рассматриваться как воспаление, вызванное несоответственно расширенными компонентами нормального бактериального сообщества.

У мышей IL-10 knockout самое малое количество липополисахаридов вызывает преждевременные роды (26). Эти открытия предполагают, что уменьшенные кишечные Clostridium не могут создать приемлемое количество регуляторных Т-клеток, что приводит к восприимчивости к воспалению. В самом деле, в отчётах о преждевременных родах говорится об уменьшенном количестве регуляторных Т-клеток и деятельности в периферической крови (27-31), хотя уровень кишечных регуляторных Т-клеток в этом исследовании не ясен. Необходимы дальнейшие исследования для прояснения связи между микрофлорой и периферическими регуляторными Т-клетками или кишечными регуляторными Т-клетками.

Площадь пика таксономической оперативной единицы 919 (Clostridiumcluster XI, ClostridiumsubclusterXIVa) в группе с недоношенными детьми была значительно шире, чем в группе с преждевременными родами и доношенными детьми (P= 0.0285). Таким образом, нужно заново оценить виды бактерий, используя метагеномный анализ.

В данном исследовании были идентифицированы некоторые ограничивающие условия. Из-за небольшого количества людей в каждой группе (меньше 30) нужна информация, которая может исходить из участия пациентов в клинических исследования, чтобы лучше обращаться с преждевременными родами. Мы не проверяли уровень регуляторных Т-клеток в периферической крови и поэтому не могли сравнить связь между фекальной микрофлорой матери и уровнем регуляторных Т-клеток. Нужны дальнейшие исследования, чтобы понять, связаны ли различия в кишечной микрофлоре с экспрессией иммунорегуляторных Т-клеток или клеток Th17, вызывающих воспаление, которые сами вызваны штаммами Clostridium и сегментированными и нитевидными бактериями соответственно. Возможно, что неидентифицированные нарушители спокойствия  могут воздействовать на изменения в микробных сообществах. Альтернативная интерпретация – как сообщили Аагаард и др. (12), собрание вагинальных микробных генов 16S рРНК  может уникально меняться при беременности с учётом возраста будущей матери. Дальнейшие исследования нужны для определения связи между различиями в таксономических оперативных единицах некоторых филотипов и преждевременными родами с недоношенными детьми. Из-за перекрёстной натуры исследования, наши открытия по поводу причинно-следственных связей  фекальной микрофлоры и преждевременными родами нужно интерпретировать с осторожностью. Мы не измеряли концентрации органических кислот, индола и аммония. Также мы не измеряли рН и влажность и не сравнивали эти значения со значениями при нормальной беременности. Селекция оптимального образца анализа конечного ограничительного фрагмента – это предмет оживлённой дискуссии в исследованиях микробиома.  Анализ лишь идентифицирует сходства и различия в микробном сообществе, и таксономические оперативные единицы, получившиеся в результате, не соответствуют  особым видам. К сожалению, у нас нет идеального набора образцов анализа фекального и вагинального микробиома. Хотя данные анализа могут быть вновь анализированы с использованием различных статистических алгоритмов, чтобы выяснить сходства и различия между сообществами и обозначить приемлемое сообщество кишечника и вагины. Мы не можем понять важность результатов – пациенты с недоношенными детьми имели большее количество таксономических единиц филотипаLactobacillares, чем те, кто родили в срок. Но идентификация различий в общем количестве таксономических единиц доказывает то, что изучение кишечной микробиоты во время беременности может предоставить важные догадки по поводу связи между колебаниями микробных сообществ и неблагоприятных исходов беременности – например, преждевременные роды. Нужны дальнейшие исследования для подтверждения этой догадки и выяснения роли кишечной микрофлоры при преждевременных родах и недоношенности. Анализ главных компонентов – не самая лучшая техника анализа данных. Таким образом, проводить его нужно с осторожностью.

Было проведено много исследований для идентификации различий в микробном разнообразии между здоровыми людьми и пациентами с ревматоидным артритом (32), воспалительной болезнью кишечника (33) и диабетом I типа (34). Однако результаты по поводу уровня клостридий в фекалиях этих пациентов не совпадают (уменьшение (32), без изменений (33) и увеличение (34)). При обнаружении аномалий в фекальной микрофлоре группы с преждевременными родами и доношенными детьми возникает вопрос, является ли дисбактериоз причиной или результатом преждевременных родов. Мы полагаем, что изменения в иммунной системе через фекальный дисбактериоз  может изменить маточную деятельность. Кроме того, нужно всё ещё разъяснить механизмы, лежащие в основе изменений микрофлоры. Приём пробиотической еды связан с уменьшением риска спонтанных преждевременных родов и преэклампсии (35, 36). Нужны исследования для выяснения того, может ли кишечный дисбактериоз при беременности вызвать маточное воспаление и сокращение матки или вызревание шейки матки во время беременности.

 

Дисбактериоз как одна из причин преждевременных родов

Нарушения в кишечной микрофлоре, дисбактериоз при беременности были отмечены в этом исследовании в группе с преждевременными родами и недоношенными детьми. Эти нарушения могут вызывать воспалительные реакции в матке, которые ведут к преждевременным родам. Тем не менее, для выяснения связи между преждевременными родами и дисбактериозом необходимы дальнейшие исследования .

 

Таблица 1. Клинические характеристики участвовавших.

Характеристики

Роды в срок (кол-во: 20)

Преждевременные роды (доношенный ребёнок) (кол-во: 11)

Преждевременные роды (недоношенный ребёнок) (кол-во: 10)

Анализ многочисленного сравнения Бонферрони

Материнский возраст (год; среднее значение)

34.0 (27-41)

30.5 (22-37)

33.4 (22-41)

P = 0.2134

Гестационные недели при собрании образцов (среднее значение)

28.6 (23-34)

28.5 (22-33)

28.0 (22-34)

P = 0.9351

Гестационные недели при родах (среднее значение)

39.2 (37-41)

37.9 (37-40)

33.4 (27-36)

P = 0.0000

Предыдущие преждевременные роды (процент)

10.0 (2/20)

9.1 (1/11)

10.0 (1/10)

P = 0.7897

Курение во время беременности

0/20

0/11

0/10

-

Количество детей в семье

0.9 (0-2)

1.1 (0-2)

0.4 (0-2)

P = 0.1651

Нерожавшие (процент)

40.0 (8/20)

27.3 (3/11)

70.0 (7/10)

P = 0.3169

ИМТ при собрании образцов (среднее значение)

23.3 (17.6 –29.1

23.2 (18.9 - 29.4)

21.7 (17.0 – 27.2)

P = 0.3263

 

 

Таблица 2. Таксономические оперативные единицы в фекальных образцах

ТОЕ

Бактерии

1 группа

2 группа

3 группа

Анализ Бонферрона

False Discovery

Rate P value

106

ClostridiumsubclusterXIVa

1.85 + - 0.75

0.33 + -0.27

0.19 + - 0.13

NS

NS

110

Clostridiumcluster IV

1.25 + -0.42

3.89 + - 2.99

3.03 + -1.30

NS

NS

124

Bifidobacterium

11.19 + - 1.98

14.10 + - 4.08

5.91 + -2.61

NS

NS

168

Clostridiumcluster IV

0.52 + - 0.15

0.18 + -0.18

0.08 + -0.08

NS

NS

317

Prevotella

4.58 + -2.79

0.31 + -0.16

0.99 + -0.60

NS

NS

332

Lactobacillares

1.29 + -0.34

1.91 + -0.60

0.87 + -0.42

NS

NS

338

Clostridiumcluster IV

0.57 + -0.16

0.37 + -0.19

0.00 + -0.00

NS

NS

366

Bacteroides

3.56 + -1.13

4.62 + -1.96

5.71 + -2.38

NS

NS

369

Clostridiumcluster IV

0.27 + - 0.18

0.89 + -0.86

2.76 + -1.32

NS

NS

469

Bacteroides

37.10 + - 3.33

30.44 + - 5.66

22.76 + - 4.44

NS

NS

494

ClostridiumsubclusterXIVa

5.90 + -1.51

10.49 + - 4.46

10.51 + -5.04

NS

NS

520

Lactobacillares

0.79 + -0.33

0.18 + -0.12

0.00 + -0.00

NS

NS

650

Clostridiumcluster XVIII

2.12 + -0.34

0.70 + -0.35

0.26 + -0.21

1 гр. – 3 гр. P = 0.0016;

1 гр. – 2 гр. P = 0.0150

1 гр. – 3 гр. P = 0.0125;

1 гр. – 2 гр. P = 0.0449

657

Lactobacillares

5.18 + -2.54

17.63 + - 8.29

24.24 + -7.17

1 гр. – 3 гр. P = 0.0497

NS (P = 0.1089)

749

Clostridiumcluster IV

6.41 + -1.15

2.90 + -1.22

0.80 + -0.80

1 гр. – 3 гр. P = 0.0060

 

1 гр. – 3 гр. P = 0.0289

754

ClostridiumsubclusterXIVa

1.70 + -0.28

1.63 + -1.03

0.00 + -0.00

NS

NS

853

Bacteroides

0.84 + -0.13

0.60 + -0.27

0.07 + - 0.07

1 гр. – 3 гр. P = 0.0087

1 гр. – 3 гр. P = 0.0348

919

Clostridium cluster XI, Clostridium

subclusterXIVa

1.30 + - 0.23

0.36 + - 0.16

2.06 + -0.55

2 гр. – 1 гр. P = 0.0047

2 гр. – 1 гр. P = 0.0285

940

ClostridiumsubclusterXIVa,

Enterobacteriales

3.79 + -0.68

3.62 + -1.10

11.43 + - 3.72

NS

NS

955

ClostridiumsubclusterXIVa

5.37 + - 0.64

1.72 + -0.80

0.34 + -0.34

1 гр. – 3 гр.P = 0.0000;

1 гр. – 2 гр.P = 0.0012

1 гр. – 3 гр. P = 0.0005;

1 гр. – 2 гр. P = 0.0125

990

ClostridiumsubclusterXIVa

3.61 + -0.69

2.87 + -0.86

7.98 + -6.66

NS

NS

 

Таблица 3. Таксономические оперативные единицы в вагинальных образцах

ТОЕ

Бактерии

1 группа

2 группа

3 группа

Значение Р

57

Неизвестно

8.78 + -1.77

12.58 + -4.12

10.12 + -2.61

NS

74

Enterococcus

0.47 + -0.27

0.36 + - 0.31

0.72 + -0.49

NS

93

Chitinophagaceae

1.20 + -0.53

4.25 + -2.74

4.16 + -2.41

NS

98

Prevotella

0.54 + -0.24

2.39 + -2.19

5.45 + -2.30

NS

134

Bifidobacterium

0.89 + -0.86

0.05 + -0.05

2.23 + -1.78

NS

147

Firmicutes

2.37 + -1.56

0.28 + -0.13

3.94 + -3.55

NS

163

Actinobacteria

3.17 + -1.67

0.01 + - 0.01

5.78 + -4.93

NS

170

Firmicutes

0.33 + - 0.17

0.74 + -0.35

0.53 + -0.28

NS

179

Lactobacillus

27.42 + -8.09

34.34 + -12.45

25.4 + -68.72

NS

189

Lactobacillus

43.41 + -8.38

39.68 + -13.11

29.01 + -10.90

NS

230

Firmicutes

0.41 + -0.15

0.59 + -0.38

0.37 + -0.25

NS

281

Actinobacteria

6.34  + -4.12

1.16 + -1.04

2.95 + -2.95

NS

300

Clostridiales

1.03 + -0.59

0.08 + -0.08

5.73 + -4.40

NS

563

Streptococcus

0.18 + -0.15

0.78 + -0.78

0.92 + -0.41

NS

573

Lactobacillus

3.24 + -1.29

2.39 + -1.35

2.62 + -0.91

NS

 

 

Читайте также:

Чем опасен дисбактериоз у беременных

Бактериальные инфекции при беременности

Изменения микрофлоры и метаболические изменения во время беременности